根据《海军舰艇命名条例》，1级舰和核潜艇是由总参谋部命名，2级和以下级别的舰艇由海军司令部命名。
[1]原则如下：巡洋舰以及以上级别军舰可以命名一级行政区省、自治区、直辖市的名字；驱逐舰和护卫舰可以使用大、中型城市的名字；猎潜艇、导弹艇使用县名，扫雷艇使用村名，大型登陆舰用山名，中型登陆舰使用河流名。

以上名字从该舰所属舰队管辖区中选择。北海舰队的辖区为东北、华北、西北地区，东海舰队的辖区华东和新疆自治区，南海舰队为华南和西南地区。
[2]潜艇命名：核动力潜艇为长征；常规导弹潜艇为远征；常规潜艇为长城，后面再加上各自的舷号就是舰名。

除此之外 一些非战斗舰有的是以著名历史人物命名的：例如郑和号训练舰，世昌号国防动员舰，李四光号海洋测量船等。